摘要: 近幾年研究表明端粒酶與腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),推測可能是一個廣泛的腫瘤標(biāo)志物。本文就端粒酶活性檢測的原理,端粒酶的提取方法,TRAP擴增技術(shù),四種結(jié)果分析方法(同位素法、染色法、熒光法和ELISA法)以及如何進行質(zhì)量控制與半定量測定進行綜述。
端粒酶(Telomerase)是由RNA和蛋白質(zhì)組成的一種核糖核蛋白酶。人端粒酶RNA組分(hTR)于1995年被克隆,其中含有端粒重復(fù)序列的模板(5′-CUAACCCUAAC-3′);蛋白質(zhì)組分具有RNA依賴的DNA多聚酶活性,結(jié)構(gòu)尚不清楚。端粒酶能以自身RNA的模板區(qū)為模板復(fù)制合成端粒序列。在胚性細(xì)胞等增殖活躍的細(xì)胞中具有端粒酶活性,而在正常成熟體細(xì)胞中端粒酶失活,同時還發(fā)現(xiàn)絕大多數(shù)腫瘤細(xì)胞都呈端粒酶陽性,而在癌旁組織和正常組織陽性率很低,推測端粒酶可能是一個廣泛的腫瘤標(biāo)志物[1]。因此近幾年端粒酶在各種腫瘤中的研究日益深入,同時促進了檢測方法的改進與完善。本文對其檢測方法綜述如下。
1 基本原理
端粒酶在體外可以以其自身RNA的模板區(qū)為模板,在適宜的寡核苷酸鏈的末端添加6個堿基的重復(fù)序列,用聚丙烯酰胺(PAGE)凝膠電泳可顯示6個堿基差異的梯帶。1994年Kim建立了基于PCR基礎(chǔ)上的端粒重復(fù)序列擴增法(telomeric repeat amplification protocol, TRAP)。TRAP反應(yīng)原理見下圖。
首先合成一個18nt的TS做上游引物,端粒酶結(jié)合TS末端的GTT并合成agggttag,然后每經(jīng)過一次轉(zhuǎn)位合成一個ggttag的6堿基重復(fù)序列,端粒酶滅活后,加入一個24nt的CX做下游引物,經(jīng)過多次變性-退火-延伸,擴增端粒酶延伸產(chǎn)物。
2 基本技術(shù)方法
2.1 標(biāo)本來源 手術(shù)摘除組織,針吸活檢組織,胸水,腹水,膀胱或胰管沖洗液,棉拭子所取分泌物和尿液(尚有爭議)等。
2.2 端粒酶的提取方法 早期采用超聲等物理破碎的方法在不同細(xì)胞中的提取效率差異較大,此后采用去污劑(如CHAPS)裂解的方法在少量細(xì)胞獲取了較穩(wěn)定的端粒酶提取液,F(xiàn)詳述如下:40~100mg冷凍(-70%℃)組織或104~106沉淀細(xì)胞用冰預(yù)冷的洗液[10mM hepes-KOH(pH7.5), 1.5mM MgCl2, 10mM KCI, 1Mm DTT]洗1次,10000g4℃離心1min,沉淀加200μl冷裂解液[10mM tris-HCI(Ph7.5), 1mM MgC12,1mM EGTA, 0.1mM PMSF, 5mM β-巰基乙醇,0.5%CHAPS,10%甘油],自動勻漿器冰浴中勻漿,450rpm,25min, 16000g4℃離心20min,移取上清160μl,部分樣品用于蛋白定量,其余迅速冷凍,-70℃保存。端粒酶經(jīng)小于10次凍融可保持活性穩(wěn)定。部分學(xué)者對某些標(biāo)本用0.5%Tween-20代替0.5%CHAPS獲得更好的效果[2]。
2.3 TRAP擴增 50μlTRAP體系包含20mM tris-HCI(pH8.3),1.5mM MgCI,63mM, KCI, 0.005%Tween-20,1mM EGTA, 50μMdNTP,0.1μg tS,1μg T4基因32蛋白,0.1mg/ml牛血清白蛋白,1~2μlCHAPS細(xì)胞提取液(含6μg)蛋白,0.2~0.4μl[α-32P]dGIP或[α-32P]dGIP(10μCi/μl, 3000Ci/mmol),這一反應(yīng)體系可同時滿足端粒酶Tap聚合酶的活性需要,23℃10min合成端粒酶延伸產(chǎn)物后,94℃3s滅活端粒酶,加入0.1μg cX和2U Taq酶,94℃30s,50℃30s,72℃1.5min擴增27個循環(huán),25μl產(chǎn)物進行15%PAGE 凝膠電泳。
2.4 引物設(shè)計 為了防止上、下游引物之間的結(jié)合,在CX引物上設(shè)計了3個不匹配堿基(見圖1*處),單鏈結(jié)合蛋白T4基因32蛋白可進一步避免引物之間的結(jié)合,TS和CX引物被廣為采用,在上述條件下,只有延伸了三至更多的GGTTAG片斷才有特異擴增,即得到從40bp開始的6bp差異的梯帶。Broccoli等以5′-GGCGCG(ACCCTA)3-3′代替CX引物,由于增加了G-C含量,可提高退火溫度,進一步避免引物間的結(jié)合,增加特異性[3]。Oncor公司設(shè)計RP引物代替CX引物,得到從50bp開始的6bp差異的梯帶[4]。
3 擴增片斷的檢測
3.1 同位素法 Kim建立的方法即為同位素法,其應(yīng)用最多。采用[α-32P]dGTP或dCTP摻入的報道很多,但部分學(xué)者用[γ-32P]dATP和T4激酶標(biāo)記TS引物的5′端,發(fā)現(xiàn)更易于檢出低水平的端粒酶,同時更易定量[3,5]。PAGE凝膠電泳后在X-光片上放射自顯影或用Phosphoimager儀掃描測定3h。同位素法的優(yōu)點是靈敏度高,100個永生化細(xì)胞27個循環(huán)即可檢出,缺點是存在放射性污染,且放射自顯影需8h至兩天以上時間,時間較長。
3.2 染色法 電泳后用SYBR green或EB染色,然后紫外燈下觀察或用CCD圖像系統(tǒng)測定[4,6,7]。EB在302nm紫外透射儀和桔紅色紫外濾光片下效果最好,可得與SYBR green相近的敏感性。染色法簡便,快速,靈敏度為100個永生化細(xì)胞30個循環(huán),由于染色帶的信號強度不能精確反映其分子數(shù)(大片斷染色更強),因此染色法只能判定相對端粒酶活性,而不能測定端粒酶延伸產(chǎn)物的確切數(shù)量。
3.3 熒光法 加入10pmol熒光素標(biāo)記(如FAM,F(xiàn)ITC)的TS和/或CX引物擴增,經(jīng)8%的變性PAGE凝膠電泳,DNA測序儀自動讀取數(shù)值,片斷管理系統(tǒng)軟件自動計算掃描曲線的峰高和峰面積,從上樣到出結(jié)果僅需90min。熒光系統(tǒng)極敏感,為避免過量擴增產(chǎn)物可能給出不可靠結(jié)果,要使用0.5~1.0μg的低蛋白量,擴增27個循環(huán),由于片斷管理系統(tǒng)能自動檢出很微弱的熒光,因此不能精確測定低水平端粒酶活性[8~11]。熒光法的另一應(yīng)用是于原位—TRAP分析,可以在細(xì)胞水平上檢出端粒酶活性,因此可以判定是哪些細(xì)胞、多少細(xì)胞具有端粒酶活性,而裂解提取法不能知其活性的細(xì)胞來源。原位分析在硅化玻片上進行,熒光顯微鏡下觀察結(jié)果。目前只用于新鮮標(biāo)本,用凍存病理標(biāo)本的實驗尚不成功,需改進方法防止凍融中胞內(nèi)端粒酶的分散及增加標(biāo)本的滲透性等[12]。
3.4 ELISA法 TS引物5′端標(biāo)以生物素,PCR擴增后,將產(chǎn)物變性,加入地高辛標(biāo)記的可與擴增產(chǎn)物的重復(fù)片斷特異結(jié)合的探針,雜交產(chǎn)物上的生物素與固定在微孔板上的卵白素相結(jié)合,而探針上的地高辛與過氧化物酶標(biāo)記的抗地高辛抗體結(jié)合,然后加入底物,顯色后用酶標(biāo)儀測定。ELISA法是寶靈曼試劑盒使用的方法,由于沒有電泳,因此觀察不到6bp差異的梯帶。
4 質(zhì)量控制
4.1 排除假陽性 設(shè)置以下四種對照(1)85℃10min滅活端粒酶;(2)端粒酶對RN ase敏感,0.5μg/10μl提取液+1μgRNase,37℃,20min;(3)不加提取液;(4)不加CX或TS引物。以上實驗可排除引物二聚體或PCR污染。
4.2 排除假陰性 (1)以陽性細(xì)胞沉淀(106細(xì)胞)的裂解提取液為陽性對照進行TRAP分析可以排除由于試劑質(zhì)量不好造成的假陰性。(2)組織提取液中Taq酶抑制物的存在會造成假陰性,為此Wright等加入一個150bp的內(nèi)標(biāo)準(zhǔn)。內(nèi)標(biāo)準(zhǔn)的獲得方法如下:設(shè)計TS加長引物:5′-AATCCGTCGAGCAGAGTTGTGAATGAGGCCTTC-3′和CX加長引物:5′-(CCCTTA)3CCCTAATAGGCGCTCAATGTA-3′,分別在TS和CX引物的3′端增加15個堿基,可與編碼鼠肌蛋白的97~132位氨基酸的堿基匹配,擴增后得到150bp產(chǎn)物,柱純化后備用。每個TRAP反應(yīng)加入15ag內(nèi)標(biāo)為模 板,TS和CX引物既可擴增端粒酶延伸產(chǎn)物,又可擴增150bp的內(nèi)標(biāo),當(dāng)無150bp擴增帶出現(xiàn)時說明存在Taq酶抑制劑,這對內(nèi)標(biāo)為眾多學(xué)者所采用。也有其它學(xué)者采用200bp或36bp的內(nèi)標(biāo)[4,8,14]。(3)稀釋提取液可降低酶抑制物濃度,擴增帶從無到有說明含酶抑制物。為了減少甚至排除某些標(biāo)本中存在的抑制物的影響,許多學(xué)者在得到端粒酶延伸產(chǎn)物后進行酚-氯仿-異戊醇(25:24:1)抽提,酒精沉淀純化[14,15]。
5 端粒酶活性的半定量檢測
由于端粒酶活性在少數(shù)正常組織細(xì)胞中有微弱的表達(dá),而且與細(xì)胞的增殖活躍程度、腫瘤的惡變程度及預(yù)后等有關(guān),因此半定量測定端粒酶活性在臨床應(yīng)用上意義重大。簡便的方法是通過10倍稀釋提取液以有無6bp差異的梯帶產(chǎn)物為標(biāo)準(zhǔn)。在任何稀釋度下無產(chǎn)物為(-);不稀釋下有產(chǎn)物為(+);10倍稀釋下有產(chǎn)物為(++);100倍稀釋下有產(chǎn)物為(+++),還可再進行1000倍稀釋[16~18]。Wright等將內(nèi)標(biāo)引入后使端粒酶活性的半定量檢測成為可能,將6bp差異的梯帶強度總和和除以內(nèi)標(biāo)的強度進行標(biāo)準(zhǔn)化后,在10~11000個細(xì)胞間具有很好的線性關(guān)系,而無內(nèi)標(biāo)時在大于300個細(xì)胞即進入平臺。許多學(xué)者采用這種方法描述相對端粒酶活性[18,19]。Oncor試劑盒(1996年第2版)提供了更為準(zhǔn)確的方法,用Phosphoimager儀掃描測定凝膠信號,TPG(Total product Generated,總生成產(chǎn)物)單位=((x-x0)/c)/((r-r0)/c)×100(TSR8為0.1amol),其中x代表無熱滅活處理標(biāo)本管中梯帶信號總和;x0代表熱滅活管信號;r代表TSR8質(zhì)控管梯帶信號總和,TSR8是人工合成的寡核苷酸鏈,由于TS連接AG(GGTTAG)7構(gòu)成;r0代表無標(biāo)本的裂解液對照管信號;c和cR分別代表無熱滅活處理標(biāo)本管和TSR8質(zhì)控管中內(nèi)對照的信號,每個TPG單位相當(dāng)于1×10-3amol或600個TS引物分子30℃,10min延伸至少4個端粒重復(fù)序列的數(shù)量,在1~300TPG(相當(dāng)于約30~10000個陽性對照細(xì)胞中所含端粒酶活性)范圍內(nèi)成線性。
5 小結(jié)
kim建立了TRAP方法為端粒酶活性的檢測提供了一個有力的手段,此后許多學(xué)者又進行了改進,尤其是內(nèi)標(biāo)的引入使得借助某些分析儀可以進行較精確的半定量測定。四種結(jié)果分析方法中,同位素法靈敏度高,但存在放射性污染,臨床推廣有一定難度;熒光法雖需進口的貴重儀器,但其敏感、快速、自動化程度最高,且易于半定量;染色法和ELISA法簡便、快速,結(jié)合稀釋法可以進行簡單的半定量,后三種方法均有應(yīng)用前景。
參考文獻(xiàn)
1 Kim NW, Piatyszek MA, prowse KR, et al. Science, 1994;266:2011
2 Miura N, Horikawa I, nishimoto A, et al. Cancer Genet Cytogenet, 1997;93:56
3 Broccoli D, Young JW, lange T, et al. Cell Biol, 1995;92:9082
4 Brien TP, Kallakury BV, lowry CV, et al. Cancer Res, 1997;57:2760
5 Chadeneau C, Hay K, Hirte hW, et al. Cancer Res, 1995;55:2533
6 Pao BC, Tseng CJ, Lin CY, et al. J Clin Oncol, 1997;15:1932
7 Kyo S, Takakura M, ishikawa H, et al. Cancer Res, 1997;57:1863
8 Heine B, Hrmmel M, Mller m, et al. J Pathol, 1998;184:71
9 Ohyashiki JH, Ohyashiki k, Sano T, et al. Jpn J Cancer Res, 1996;87:329
10 Suda T, Isokawa O, aoyagi Y, et al. Hepatology, 1998;27:402
11 Iwama H, Ohyashiki K, ohyashiki JH, et al. Hum Genet, 1998;102:397 12 Ohyashiki K, Ohyashiki JH, nishimaki J, et al. Cancer Res, 1997;57:2100
13 Wright WE, Shay JW, piatyszek MA, et al. Nucleic Acids Res, 1995;23:3794
14 Linn JE, Lango M, halachmi S, et al. Int J Cancer, 1997;57:2144
15 Umbricht CB, Saji M, westra WH, et al. Cancer Res, 1997;57:2144 16 Lin Y, Vemura H, fujinami K, et al. J Urol, 1997;57:1161
17 Kojima H, Yokosuka O, imazeki F, et al, J Urol, 1997;157:1161
18 Tsutsumi M, Tsujiuchi T, ishikawa O, et al. Jpn J Cancer Res, 1997;88:931
19 Hiyama E, Kodama T, sh inbara K, et al. Cancer Res, 1997;57:326
20 Nakashio R, Kitamoto M, tahara H, eu al. Int J Cancer, 1997;74:141
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