RNA的轉(zhuǎn)錄合成從化學(xué)角度來講類似于DNA的復(fù)制,多核苷酸鏈的合成都是以5’→3’的方向,在3’-OH末端與加入的核苷酸磷酸二酯鍵,但是,由于復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的目的不同,轉(zhuǎn)錄又具有其特點(diǎn):(1)對于一個基因組來說,轉(zhuǎn)錄只發(fā)生在一部分基因,而且每個基因的轉(zhuǎn)錄都受到相對獨(dú)立的控制(圖17-2);(2)轉(zhuǎn)錄是不對稱的。(3)轉(zhuǎn)錄時不需要引物,而且RNA鏈的合成是連續(xù)的。
一、依賴DNA的RNA聚合酶
真核和原核細(xì)胞內(nèi)都存在有DDRP,迄今發(fā)現(xiàn)的DDRP的有以下特點(diǎn):①以DNA為模板;在DNA的兩條多苷酸鏈中只有其中一條鏈作為模板,這條鏈叫做模板鏈(template strand),又叫做無意義鏈。DNA雙鏈中另一條不做為模板的鏈叫做編碼鏈,又叫做有意義鏈,編碼鏈的的序列與轉(zhuǎn)錄本RNA的序列相同,只是在編碼鏈上的T在轉(zhuǎn)錄本RNA為U,由于RNA的轉(zhuǎn)錄合成是以DNA的一條鏈為模板而進(jìn)行的,所以這種轉(zhuǎn)錄方式又叫做不對稱轉(zhuǎn)錄。②都以四種三磷酸核苷的底物,原料;③都遵循DNA與RNA之間的堿基配對原由,A=U,T=A,C=G,合成與模板DNA序列互補(bǔ)的RNA鏈。④RNA鏈的延長方向是5’→3’的連續(xù)合成。⑤需要Mg2+或Mn2+離子。⑥并不需要引物。RNA聚合酶缺乏3’→5’外切酶活性,所以沒有校正功能。
圖17-2 細(xì)菌染色體上幾個基因轉(zhuǎn)錄的方向及所用模板
RNA聚合酶催化下列反應(yīng):
大腸桿菌RNA聚合酶的研究得比較透徹的,這是一個分子量達(dá)50多萬,全酶由五咱亞基組成,去掉δ亞基的部分稱為核心酶,核心酶本身就能催化苷酸間磷酸二酸鍵形成。利福平和利福霉素能結(jié)合在β亞基上而對此酶發(fā)生強(qiáng)烈的抑制作用。β亞基似乎是酶和核苷酸底物結(jié)合的部位。細(xì)胞內(nèi)轉(zhuǎn)錄是在DNA特定的起始點(diǎn)上開始的,δ亞基的功能是辨認(rèn)轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的。β’亞基是酶與DNA模板結(jié)合的主要成分。α亞基可能與轉(zhuǎn)錄基因的類型和種類有關(guān)。
表17-1 大腸桿菌RNA聚合酶
亞單位 | 分子量 | 亞單位數(shù)目 | 功能 |
α β β δ |
36512
150618 155613 70263 |
2
1 1 1 |
決定哪此基因被轉(zhuǎn)錄
與轉(zhuǎn)錄全過程有關(guān) 結(jié)合DNA模板 辨認(rèn)起始點(diǎn) |
真核生物中已發(fā)現(xiàn)有四種RNA聚合酶,分別稱為RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和線粒體RNA聚合酶,分子量大致都在50萬道爾頓左右,它們專一性地轉(zhuǎn)錄不同的基因,因此由它們催化的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物也各不相同。RNA聚Ⅰ合成RNA的活性最顯著,它位于核仁中,負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)錄編碼rRNA的基因。而細(xì)胞內(nèi)絕大部分RNA是rRNA是RNA。RNA聚合酶Ⅱ,位于核質(zhì)中,負(fù)責(zé)核內(nèi)不勻一RNA的合成,而hnRNA是mRNA的前體。RNA聚合酶Ⅲ負(fù)責(zé)合成tRNA和許多小的核內(nèi)RNAs。鵝膏蕈堿是真核生物RNA聚合酶特異性抑制劑,三種真核生物RNA聚合酶對鵝膏蕈堿的反應(yīng)不同,見表17-2,原核生物靠RNA聚合酶就可完成從起始、延長、終止的轉(zhuǎn)錄全過程,真核生物轉(zhuǎn)錄除RNA聚合酶外還需另一此叫做轉(zhuǎn)錄因子的蛋白質(zhì)分子參與轉(zhuǎn)錄的全過程,見后敘。
表17-2 真核生物的RNA聚合酶
種類 | 分布 | 合成的RNA類型 | 對α-鵝膏蕈堿的敏感性 |
Ⅰ
Ⅱ Ⅲ Mt |
核仁
核質(zhì) 核質(zhì) 線粒體 |
rRNa hnRNA tRNA,5sRNA 線粒體RNAs |
不敏感 低濃度敏感 高濃度敏感 不敏感 |
二、RNA的轉(zhuǎn)錄過程
轉(zhuǎn)錄的主要過程見圖17-3,為研究和敘述方便,可將RNA合成分為識別與起始、延長和終止三個階段。
圖17-3 轉(zhuǎn)錄的主要過程