從前節(jié)敘述中，已可看出基因治療的研究與實(shí)踐中存在著若干重要問(wèn)題。
1．導(dǎo)入基因的穩(wěn)定高效表達(dá)外源基因轉(zhuǎn)移入病人體內(nèi)細(xì)胞表達(dá)，首先與轉(zhuǎn)移方法有關(guān)�；瘜W(xué)和物理方法所導(dǎo)入的基因效率低，自然表達(dá)也差。選擇適當(dāng)?shù)氖荏w細(xì)胞，也是為了導(dǎo)入基因能穩(wěn)定高效的表達(dá)。骨髓作為受體細(xì)胞使用最多。反轉(zhuǎn)錄病毒載體介導(dǎo)基因，只能對(duì)分裂狀態(tài)時(shí)的細(xì)胞進(jìn)行傳染，因此采取如5－FU處理，使細(xì)胞分裂增強(qiáng)，再用含有目的基因病毒顆粒傳染可獲較好效果。所以，對(duì)骨髓細(xì)胞培養(yǎng)、干細(xì)胞純化、培養(yǎng)時(shí)使用造血因子等方法，可增加基因穩(wěn)定高效表達(dá)。
2．導(dǎo)入基因的安全性基因治療的安全性應(yīng)確保不因?qū)胪庠茨康幕蚨a(chǎn)生新的有害遺傳變異，這是因?yàn)椴捎梅崔D(zhuǎn)錄病毒載體而引起的問(wèn)題。因此，應(yīng)構(gòu)建相對(duì)安全的反轉(zhuǎn)錄病毒載體。至于引起插入突變可能失活一個(gè)重要基因，或更嚴(yán)重的激活一個(gè)原癌基因，這個(gè)問(wèn)題的危險(xiǎn)程度到底有多大目前仍不清楚，但至今的實(shí)踐表明尚未見明顯嚴(yán)重問(wèn)題。
為安全有效地進(jìn)行基因治療，任一方案的實(shí)施，都要根據(jù)嚴(yán)格的技術(shù)規(guī)程與標(biāo)準(zhǔn)，由有關(guān)的行政管理部門批準(zhǔn)實(shí)施。
與安全性相聯(lián)系的就是生殖細(xì)胞基因治療。雖然在人類尚未實(shí)施，但在動(dòng)物實(shí)驗(yàn)已獲成功，這就是轉(zhuǎn)基因的動(dòng)物出現(xiàn)。這一事實(shí)既給人類生殖細(xì)胞基因治療帶來(lái)了希望，同時(shí)也使人們耽心這種遺傳特征的變化世代相傳，將給人類帶來(lái)的是福還是禍。因此，許多科學(xué)家不僅對(duì)此持慎重態(tài)度，還有的持反對(duì)態(tài)度，也就是基因治療可能具有的潛在危險(xiǎn)性。
3．基因治療與社會(huì)倫理道德體細(xì)胞基因治療是符合倫理道德的，但試圖糾正生殖細(xì)胞遺傳缺陷或通過(guò)遺傳工程手段來(lái)改變正常人的遺傳特征則是引起爭(zhēng)議的領(lǐng)域。從歷史上看，科學(xué)的發(fā)明創(chuàng)造對(duì)人類生存發(fā)展的影響極其深刻，故遺傳學(xué)發(fā)展到今天，可以進(jìn)行基因治療，應(yīng)該說(shuō)是符合倫理道德的。重要的問(wèn)題是取得社會(huì)的理解配合。首先是病人及其親屬的配合。因此，宣傳基因治療的科學(xué)性與安全性以及人類健康的重要性，以提高人們的認(rèn)識(shí)，同時(shí)建立并完善醫(yī)療法制與措施也是必要的。
為安全計(jì)，在臨床試驗(yàn)之前，必須在動(dòng)物研究中達(dá)到三項(xiàng)基本要求：①外源的基因能導(dǎo)入靶細(xì)胞并維持足夠長(zhǎng)期有效；②該基因要以足夠的水平在細(xì)胞中表達(dá)；③該基因應(yīng)對(duì)細(xì)胞無(wú)害。
