DNA雙螺旋(DNA double helix)：
一種核酸的構(gòu)象，在該構(gòu)象中，兩條反向平行的多核苷酸鏈圍繞彼此纏繞形成一個(gè)右手的雙螺旋結(jié)構(gòu)。堿基位于雙螺旋內(nèi)側(cè),磷酸與糖基在外側(cè)，通過(guò)磷酸二酯鍵相連,形成核酸的骨架。堿基平面與假想的中心軸垂直,糖環(huán)平面則與軸平行。兩條鏈皆為右手螺旋。雙螺旋的直徑為2nm，堿基堆積距離為0.34nm，兩核苷酸之間的夾角是36°，每對(duì)螺旋由10對(duì)堿基組成，堿基按A-T, G-C配對(duì)互補(bǔ)，彼此以氫鍵相連系。維持DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的力主要是堿基堆積力。雙螺旋表面有兩條寬窄、深淺不一的一個(gè)大溝和一個(gè)小溝。
大溝(major groove)和小溝(minor groove)：
繞B-DNA雙螺旋表面上出現(xiàn)的螺旋槽（溝)，寬的溝稱之大溝，窄溝稱之小溝。大溝、小溝都是由于堿基對(duì)堆積和糖-磷酸骨架扭轉(zhuǎn)造成的。
DNA超螺旋（DNA supercoiling):DNA本身的卷曲，一般是DNA雙螺旋的彎曲、欠旋（負(fù)超螺旋)或過(guò)旋（正超螺旋)的結(jié)果。
拓?fù)洚悩?gòu)酶（topoisomerase):
通過(guò)切斷DNA的一條或兩條鏈中的磷酸二酯鍵，然后重新纏繞和封口來(lái)改變DNA連環(huán)數(shù)的酶。拓?fù)洚悩?gòu)酶I通過(guò)切斷DNA中的一條鏈減少負(fù)超螺旋，增加一個(gè)連環(huán)數(shù)；而拓?fù)洚悩?gòu)酶II切斷DNA的兩條鏈增加負(fù)超螺旋，減少2 個(gè)連環(huán)數(shù)。某些拓?fù)洚悩?gòu)酶II也稱之DNA促旋酶。
核小體（nucleosome)：用于包裝染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)單位，是由DNA鏈繞一個(gè)組蛋白核纏繞構(gòu)成的。
染色質(zhì)(chromatin)：是存在于真核生物間期細(xì)胞核內(nèi)，易被堿性染料著色的一種無(wú)定形物質(zhì)。染色質(zhì)中含有作為骨架的完整的雙鏈DNA，以及組蛋白、非組蛋白和少量的RNA。
染色體(chromosome)：
是染色質(zhì)在細(xì)胞分裂過(guò)程中經(jīng)過(guò)緊密纏繞、折疊、凝縮和精細(xì)包裝形成的具有固定形態(tài)的遺傳物質(zhì)存在形式。簡(jiǎn)言之，染色體是一個(gè)大的單一的雙鏈DNA分子與相關(guān)蛋白質(zhì)組成的復(fù)合物，DNA中含有許多基因，貯存和傳遞遺傳信息。
DNA變性(DNA denaturation)：DNA雙鏈解鏈分離成兩條單鏈的現(xiàn)象。
退火（annealing): 即DNA由單鏈復(fù)性變成雙鏈結(jié)構(gòu)的過(guò)程。來(lái)源相同的DNA單鏈經(jīng)退火后完全恢復(fù)雙鏈結(jié)構(gòu)，同源DNA之間、DNA和RNA之間退火后形成雜交分子。
融解溫度(melting temperature, Tm)：雙鏈DNA融解徹底變成單鏈DNA的溫度范圍的中點(diǎn)溫度。
增色效應(yīng)（hyperchromic effect)：當(dāng)雙螺旋DNA融解（解鏈)時(shí)，260nm處紫外吸收增加的現(xiàn)象。
減色效應(yīng)（hypochromic effect)：隨著核酸復(fù)性，紫外吸收降低的現(xiàn)象。
核酸內(nèi)切酶(endonuclease)：核糖核酸酶和脫氧核糖核酸酶中能夠水解核酸分子內(nèi)磷酸二酯鍵的酶。
核酸外切酶(exonuclease)：從核酸鏈的一端逐個(gè)水解下核苷酸的酶。
限制性內(nèi)切酶（restriction endonucleases):一種在特殊核苷酸序列處水解雙鏈DNA的內(nèi)切酶。I型限制性內(nèi)切酶既催化宿主DNA的甲基化，又催化非甲基化的DNA的水解；而II型限制性內(nèi)切酶只催化非甲基化的DNA的水解。
限制酶圖譜(restriction map)：
同一DNA用不同的限制酶進(jìn)行切割從而獲得各種限制酶的切割位點(diǎn)，由此建立的位點(diǎn)圖譜有助于對(duì)DNA的結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析。
反向重復(fù)序列 (inverted repeat sequence)：
在同一多核苷酸鏈內(nèi)的相反方向上存在的重復(fù)的核苷酸序列。在雙鏈DNA中反向重復(fù)可能引起十字形結(jié)構(gòu)的形成。
重組DNA技術(shù)（recombination DNA technology):
也稱之基因工程(genomic engineering)。利用限制性內(nèi)切酶和載體，按照預(yù)先設(shè)計(jì)的要求，將一種生物的某種目的基因和載體DNA重組后轉(zhuǎn)人另一生物細(xì)胞中進(jìn)行復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和表達(dá)的技術(shù)。
基因（gene):也稱之順?lè)醋樱╟istron)。泛指被轉(zhuǎn)錄的一個(gè)DNA片段。在某些情況下，基因常用來(lái)指編碼一個(gè)功能蛋白或RNA分子的DNA片段。
分解代謝反應(yīng)（catabolic reaction):降解復(fù)雜分子為生物體提供小的構(gòu)件分子和能量的代謝反應(yīng)。
合成代謝反應(yīng)（anabolic reaction)：合成用于細(xì)胞維持和生長(zhǎng)所需要的分子的代謝反應(yīng)。
反饋抑制（feedback inhibition)：催化一個(gè)代謝途徑中前面反應(yīng)的酶受到同一途徑的終產(chǎn)物抑制的現(xiàn)象。
前饋激活（feed-forward activation)：代謝途徑中一個(gè)酶被該途徑中前面產(chǎn)生的代謝物激活的現(xiàn)象。
標(biāo)準(zhǔn)自由能變化（ΔG°)（standard free-energy change):
在一系列標(biāo)準(zhǔn)條件（溫度：298K；壓力：1個(gè)大氣壓；所有溶質(zhì)的濃度都是1M)下發(fā)生的反應(yīng)的自由能變化。ΔG°ˊ表示pH7.0條件下的標(biāo)準(zhǔn)自由能變化。
標(biāo)準(zhǔn)還原電位（E°ˊ)（standard reduction potential)：
25℃和pH7.0條件下一個(gè)還原劑和它的氧化形式在1M濃度下表現(xiàn)出的電動(dòng)勢(shì)。
酵解(glycolysis)：一個(gè)由10步酶促反應(yīng)組成的糖分解代謝途徑，通過(guò)該途徑，一分子葡萄糖轉(zhuǎn)換為兩分子丙酮酸，同時(shí)凈生成兩分子ATP和兩分子NADH。
發(fā)酵(fermentation)：營(yíng)養(yǎng)分子（例如葡萄糖)產(chǎn)能的厭氧降解，在乙醇發(fā)酵中，丙酮酸轉(zhuǎn)化為乙醇和CO2。
巴斯德效應(yīng)(Pasteur effect)：氧存在下，酵解速度放慢的現(xiàn)象。
底物水平磷酸化(substrate phosphorylation)：
ADP或某些其它的核苷-5ˊ-二磷酸的磷酸化是通過(guò)來(lái)自一個(gè)非核苷酸底物的磷�；霓D(zhuǎn)移實(shí)現(xiàn)的。這種磷酸化與電子傳遞鏈無(wú)關(guān)。
檸檬酸循環(huán)（citric acid cycle):
也稱之三羧酸循環(huán)(tricarboxylic acid cycle)，Krebs 循環(huán)（Krebs cycle)。是用于乙酰CoA中的乙�；趸蒀O2的酶促反應(yīng)的循環(huán)系統(tǒng)，該循環(huán)的第一步反應(yīng)是由乙酰CoA和草酰乙酸縮合形成檸檬酸。
回補(bǔ)反應(yīng)（anaplerotic reaction)：酶催化的補(bǔ)充檸檬酸循環(huán)中間代謝物的供給的反應(yīng)，例如由丙酮酸羧化生成草酰乙酸的反應(yīng)。
乙醛酸循環(huán)（glyoxylate cycle):
是某些植物、細(xì)菌和酵母中檸檬酸循環(huán)的修改形式，通過(guò)該循環(huán)可以由乙酰CoA經(jīng)草酰乙酸凈生成葡萄糖。乙醛酸循環(huán)繞過(guò)了檸檬酸循環(huán)中生成兩個(gè)CO2的步驟。
戊糖磷酸途徑（pentose phosphate pathway)：
也稱之磷酸己糖支路（hexose monophosphate shunt)。是一個(gè)葡萄糖-6-磷酸經(jīng)代謝產(chǎn)生NADPH和核糖-5-磷酸的途徑。該途徑包括氧化和非氧化兩個(gè)階段，在氧化階段，葡萄糖-6-磷酸轉(zhuǎn)化為核酮糖-5-磷酸和CO2,并生成兩分子的NADPH；在非氧化階段，核酮糖-5-磷酸異構(gòu)化生成核糖-5-磷酸或轉(zhuǎn)化為酵解中的兩個(gè)中間代謝物果糖-6-磷酸和甘油醛-3-磷酸。
糖醛酸途徑(glucuronate pathway)：
從葡萄糖-6-磷酸或葡萄糖-1-磷酸開(kāi)始，經(jīng)UDP-葡萄糖醛酸生成葡萄糖醛酸和抗壞血酸的途徑。但只有在植物和那些可以合成抗壞血酸（維生素C)動(dòng)物體內(nèi)，通過(guò)該途徑可以合成維生素C。
無(wú)效循環(huán)（futile cycle)：
也稱之底物循環(huán)（substrate cycle)。一對(duì)催化兩個(gè)途徑的中間代謝物之間循環(huán)的方向相反、代謝上不可逆的反應(yīng)。有時(shí)該循環(huán)通過(guò)ATP的水解導(dǎo)致熱能的釋放。例如，葡萄糖＋ATP＝葡萄糖-6-磷酸＋ADP與葡萄糖-6-磷酸＋H2O＝葡萄糖＋Pi反應(yīng)組成的循環(huán)反應(yīng)，其凈反應(yīng)實(shí)際上是ATP＋H2O＝ADP＋Pi。
磷酸解（作用)（phosphorolysis):在分子內(nèi)通過(guò)引入一個(gè)無(wú)機(jī)磷酸形成磷酸酯鍵而使原來(lái)鍵斷裂的方式。實(shí)際上引入了一個(gè)磷酰基。
半乳糖血癥（galactosemia):人類的一種基因型遺傳代謝缺陷，特點(diǎn)是由于缺乏1-磷酸半乳糖尿苷酰轉(zhuǎn)移酶導(dǎo)致嬰兒不能代謝奶汁中乳糖分解生成的半乳糖。
尾部生長(zhǎng)（tailward growth):一種聚合反應(yīng)機(jī)理，經(jīng)過(guò)活化的單體的頭部結(jié)到聚合物的尾部，連接到聚合物尾部的單體的尾部又成了接收下一個(gè)單體的受體。
糖異生作用(gluconeogenesis)：
由簡(jiǎn)單的非糖前體轉(zhuǎn)變?yōu)樘堑倪^(guò)程。糖異生不是糖酵解的簡(jiǎn)單逆轉(zhuǎn)。雖然由丙酮酸開(kāi)始的糖異生利用了糖酵解中的7步近似平衡反應(yīng)的逆反應(yīng)，但還必須利用另外4步酵解中不曾出現(xiàn)的酶促反應(yīng)繞過(guò)酵解中的三個(gè)不可逆反應(yīng)。
呼吸電子傳遞鏈（respiratory electron-transport chain)：
由一系列可作為電子載體的酶復(fù)合體和輔助因子構(gòu)成，可將來(lái)自還原型輔酶或底物的電子傳遞給有氧代謝的最終電子受體分子氧（O2)。
氧化磷酸化(oxidative phosphorylation)：
電子從一個(gè)底物傳遞給分子氧的氧化與酶催化的由ADP和Pi生成ATP的磷酸化相偶聯(lián)的過(guò)程。
化學(xué)滲透理論(chemiosmotic theory)：
一種學(xué)說(shuō)，主要論點(diǎn)是底物氧化期間建立的質(zhì)子濃度梯度提供了驅(qū)動(dòng)由ADP和Pi形成ATP的能量。
解偶聯(lián)劑（uncoupling agent):一種使電子傳遞與ADP磷酸化之間的緊密偶聯(lián)關(guān)系解除的化合物，例如2,4-二硝基苯酚。
P/O比(P/O ratio)：
在氧化磷酸化中，每1/2O2被還原時(shí)形成的ATP的摩爾數(shù)。電子從NADH傳遞給O2時(shí)，P/O比為3，而電子從FADH2傳遞給O2時(shí)，P/O比為2。
高能化合物(high energy compound)：在標(biāo)準(zhǔn)條件下水解時(shí)自由能大幅度減少的化合物。一般是指水解釋放的能量能驅(qū)動(dòng)ADP磷酸化合成ATP的化合物。
葉綠體（chloroplast)：藻類和植物中含有葉綠素進(jìn)行光合作用的器官。
葉綠素（chlorophyll)：光合作用膜中的綠色色素，它是光合生物中主要的捕獲光的成分。
輔助色素（accessory pigments):在植物和光合細(xì)菌中象類胡蘿卜素、葉黃素和藻膽（色)素那樣吸收可見(jiàn)光的色素，這類色素是對(duì)葉綠素捕獲光能的補(bǔ)充。
光合作用(photosynthesis)：綠色植物或光合細(xì)菌利用光能將CO2轉(zhuǎn)化成有機(jī)化合物的過(guò)程。
光合磷酸化(photophosphorylation)：在葉綠體ATP合成酶催化下依賴于光的由ADP和Pi合成ATP的過(guò)程。
光反應(yīng)(light reactions)：光合色素將光能轉(zhuǎn)變成化學(xué)能并形成ATP和NADPH的過(guò)程。
暗反應(yīng)(dark reactions)：利用光反應(yīng)生成的ATP和NADPH的化學(xué)能使CO2還原成糖或其它有機(jī)物的一系列酶促過(guò)程。
Calvin 循環(huán)（Cavin cycle):
也稱之還原戊糖磷酸循環(huán)（RPP cycle: reductive pentose phosphate cycle)，C3途徑（C3 pathway)。在光合作用期間，將CO2還原轉(zhuǎn)化為糖的反應(yīng)循環(huán)。是植物用于固定二氧化碳生成磷酸丙糖的循環(huán)途徑。
C4途徑（C4 pathway)：
一些植物中固定碳的途徑，其特點(diǎn)是通過(guò)使CO2濃縮減少光呼吸。在該途徑中，在葉肉細(xì)胞CO2被整合到C4酸中，然后C4酸在維管束鞘細(xì)胞被脫羧，釋放出的CO2被Calvin 循環(huán)利用。
光呼吸（photorespiration)：
植物依賴光攝取氧進(jìn)行磷酸乙醇酸代謝的過(guò)程。光呼吸之所以發(fā)生是由于O2可以與CO2競(jìng)爭(zhēng)核酮糖-1,5-二磷酸羧化氧化酶的活性部位。
β氧化途徑(βoxidation pathway)：
是脂肪酸氧化分解的主要途徑，脂肪酸被連續(xù)地在β碳氧化降解生成乙酰CoA，同時(shí)生成NADH和FADH2，因此可產(chǎn)生大量的ATP。該途徑因脫氫和裂解均發(fā)生在β位碳原子而得名。每一輪脂肪酸β氧化都是由4步反應(yīng)組成：氧化、水化、再氧化和硫解。
肉毒堿穿梭系統(tǒng)（carnitine shuttle system):脂酰CoA通過(guò)形成脂酰肉毒堿從細(xì)胞質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)到線粒體的一個(gè)穿梭循環(huán)途徑。
酮體(acetone body)：在肝臟中由乙酰CoA合成的燃料分子（β羥基丁酸、乙酰乙酸和丙酮)。在饑餓期間酮體是包括腦在內(nèi)的許多組織的燃料，酮體過(guò)多將導(dǎo)致中毒。
檸檬酸轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)（citrate transport system):
將乙酰CoA從線粒體轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞質(zhì)的穿梭循環(huán)途徑。在轉(zhuǎn)運(yùn)乙酰CoA的同時(shí)，細(xì)胞質(zhì)中的NADH氧化成NAD＋、NADP＋還原為NADPH。每循環(huán)一次消耗2分子ATP。
�；d體蛋白（ACP, acyl carrier protein)：通過(guò)硫酯鍵結(jié)合脂肪酸合成的中間代謝物的蛋白質(zhì)（原核生物)或蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)域（真核生物)。
生物固氮作用(Biological nitrogen fixation)：大氣中的氮被還原為氨的過(guò)程。生物固氮只發(fā)生在少數(shù)的細(xì)菌和藻類中。
尿素循環(huán)（urea cycle):是一個(gè)由4步酶促反應(yīng)組成的可以將來(lái)自氨和天冬氨酸的氮轉(zhuǎn)化為尿素的代謝循環(huán)。該循環(huán)是發(fā)生在脊椎動(dòng)物肝臟中的一個(gè)代謝循環(huán)。
脫氨(deamination)：在酶的催化下從生物分子（氨基酸或核苷酸分子)中除去氨基的過(guò)程。
氧化脫氨（oxidative deamination)：α-氨基酸在酶的催化下脫氨生成相應(yīng)α-酮酸的過(guò)程。氧化脫氨過(guò)程實(shí)際上包括脫氫和水解兩個(gè)步驟。
轉(zhuǎn)氨酶（transaminases)：也稱之氨基轉(zhuǎn)移酶（aminotransferases)。催化一個(gè)α-氨基酸的α-氨基向一個(gè)α-酮酸轉(zhuǎn)移的酶。
轉(zhuǎn)氨(transamination)：一個(gè)α-氨基酸的α-氨基借助轉(zhuǎn)氨酶的催化作用轉(zhuǎn)移到一個(gè)α-酮酸的過(guò)程。
乒乓反應(yīng)（ping-pong reaction)：
在該反應(yīng)中，酶結(jié)合一個(gè)底物并釋放出一個(gè)產(chǎn)物，留下一個(gè)取代酶，然后該取代酶再結(jié)合第二個(gè)底物和釋放出第二個(gè)產(chǎn)物，最后酶恢復(fù)到它的起始狀態(tài)。
生糖氨基酸(glucogenic amino acids)：那些降解能生成可作為糖異生前體分子，例如丙酮酸或檸檬酸循環(huán)中間代謝物的氨基酸。
生酮氨基酸(acetonegenic amino acid)：那些降解可生成乙酰CoA或酮體的氨基酸。
苯酮尿癥（phenylketonuria):
是由于苯丙氨酸羥化酶缺乏引起苯丙酮酸堆積的代謝遺傳病。缺乏苯丙氨酸羥化酶，苯丙氨酸只能靠轉(zhuǎn)氨生成苯丙酮酸，病人尿中排出大量苯丙酮酸。苯丙酮酸堆積對(duì)神經(jīng)有毒害，智力發(fā)育出現(xiàn)障礙。
尿黑酸癥（alcaptonuria):
是酪氨酸代謝中缺乏尿黑酸氧化酶引起的代謝遺傳病。這種病人尿中含有尿黑酸，在堿性條件下暴露于氧氣氧化并聚合為類似于黑色素的物質(zhì)，從而使尿成黑色。
核苷磷酸化酶(nucleoside phosphorylase)：能分解核苷生成含氮堿和戊糖的磷酸酯的酶。
核苷水解酶(nucleoside hydrolase)：能分解核苷生成含氮堿和戊糖的酶。
從頭合成(de novo synthesis )：
生物體內(nèi)用簡(jiǎn)單的前體物質(zhì)合成生物分子的途徑，例如核苷酸的從頭合成。
補(bǔ)救途徑(salvage pathway)：
與從頭合成途徑不同，生物分子的合成，例如核苷酸可以由該類分子降解形成的中間代謝物，如堿基等來(lái)合成，該途徑是一個(gè)再循環(huán)途徑。
痛風(fēng)（gout)：
是尿酸過(guò)量生產(chǎn)或尿酸排泄不充分引起的尿酸堆積造成的，尿酸結(jié)晶堆積在軟骨、軟組織、腎臟以及關(guān)節(jié)處。在關(guān)節(jié)處的沉積會(huì)造成劇烈的疼痛。
別嘌呤醇（allopurinol)：是結(jié)構(gòu)上（嘌呤環(huán)上第7位是C，第8位是N)類似于次黃嘌呤的化合物，對(duì)黃嘌呤氧化酶有很強(qiáng)抑制作用，常用來(lái)治療痛風(fēng)。
自殺抑制作用（suicide substrate)：底物類似物經(jīng)酶催化生成的產(chǎn)物變成了該酶的抑制劑。例如別嘌呤醇對(duì)黃嘌呤氧化酶的抑制就屬于這種抑制類型。
Lesch-Nyhan綜合癥（Lesch-Nyhan )：
也稱之自毀容貌癥，是由于次黃嘌呤-鳥(niǎo)嘌呤磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶的遺傳缺陷引起的。缺乏該酶使得次黃嘌呤和鳥(niǎo)嘌呤不能轉(zhuǎn)換為IMP和GMP，而是降解為尿酸，過(guò)量尿酸將導(dǎo)致Lesch-Nyhan綜合癥。
激素（hormone)：一類由內(nèi)分泌組織合成的微量的化學(xué)物質(zhì)，它由血液運(yùn)輸?shù)桨薪M織，起著一個(gè)信使的作用調(diào)節(jié)靶組織（器官)的功能。
激素受體（hormone receptor)：
位于細(xì)胞表面或細(xì)胞內(nèi)結(jié)合特異激素并引發(fā)細(xì)胞響應(yīng)的蛋白質(zhì)。
第二信使(second messenger)：響應(yīng)外部信號(hào)（第一信使)，例如激素而在細(xì)胞內(nèi)合成的效應(yīng)分子，例如cAMP、肌醇三磷酸或二�；视偷�。第二信使再去調(diào)節(jié)靶酶，引起細(xì)胞內(nèi)各種效應(yīng)。
級(jí)聯(lián)放大(cascade)：
在體內(nèi)的不同部位，通過(guò)一系列的酶促反應(yīng)來(lái)傳遞一個(gè)信息，并且初始信息在傳到系列反應(yīng)的最后時(shí)，信號(hào)得到放大，這樣的一個(gè)系列叫做級(jí)聯(lián)系統(tǒng)。最普通的類型是蛋白水解和蛋白質(zhì)磷酸化的級(jí)聯(lián)放大。
G蛋白(G proteins)：
在細(xì)胞內(nèi)信號(hào)傳導(dǎo)途徑中起著重要作用的GTP結(jié)合蛋白質(zhì)，由α、β、γ三個(gè)不同亞基組成。與激素受體結(jié)合的配體誘導(dǎo)GTP與G蛋白結(jié)合的GDP進(jìn)行交換，結(jié)果激活位于信號(hào)傳導(dǎo)途徑中下游的腺苷酸環(huán)化酶。G蛋白將胞外的第一信使腎上腺素等激素和胞內(nèi)的腺苷酸環(huán)化酶催化的腺苷酸環(huán)化生成的第二信使cAMP聯(lián)系起來(lái)。G蛋白具有內(nèi)源GTP酶活性。
激素效應(yīng)元件（hormone response elements, HRE)：
是指類固醇、甲狀腺素等激素受體結(jié)合的一段短的DNA序列（12～20bp)，這類受體結(jié)合DNA后可改變相鄰基因的表達(dá)。
半保留復(fù)制(semiconservative replication)：
DNA復(fù)制的一種方式。每條鏈都可用作合成互補(bǔ)鏈的模板，合成出兩分子的雙鏈DNA，每個(gè)分子都是由一條親代鏈和一條新合成的鏈組成。
復(fù)制叉（replication forks)：Y字型結(jié)構(gòu)，在復(fù)制叉處作為模板的雙鏈DNA解旋，同時(shí)合成新的DNA鏈。
DNA聚合酶（DNA polymerase)：
以 DNA為模板催化核苷酸殘基加到已存在的聚核苷酸的3ˊ末端反應(yīng)的酶。某些DNA聚合酶具有外切核酸酶的活性，可用來(lái)校正新合成的核苷酸序列。
Klenow 片段(Klenow fragment)：
E.coli DNA聚合酶I經(jīng)部分水解生成的C末端605個(gè)氨基酸殘基片段。該片段保留了DNA聚合酶I 的5ˊ-3ˊ聚合酶和3ˊ-5ˊ外切酶活性，但缺少完整酶的5ˊ-3ˊ外切酶活性。
前導(dǎo)鏈（leading strand)：與復(fù)制叉移動(dòng)的方向一致，通過(guò)連續(xù)地5ˊ→3ˊ聚合合成的新的DNA鏈。
滯后鏈（lagging strand)：與復(fù)制叉移動(dòng)的方向相反，通過(guò)不連續(xù)地5ˊ→3ˊ聚合合成的新的DNA鏈。
岡崎片段(Okazaki fragments)：
相對(duì)比較短的DNA鏈（大約1000核苷酸殘基)，是在DNA的滯后鏈的不連續(xù)合成期間生成的片段，這是Reiji Okazaki 在DNA合成實(shí)驗(yàn)中添加放射性的脫氧核苷酸前體觀察到的。
引發(fā)體（primosome):一種多蛋白復(fù)合體，E.coli中的引發(fā)體包括催化滯后鏈不連續(xù)DNA合成所需要的短的RNA引物合成的引發(fā)酶、解旋酶。
復(fù)制體(replisome)：一種多蛋白復(fù)合體，包含DNA聚合酶、引發(fā)酶、解旋酶、單鏈結(jié)合蛋白和其它輔助因子。復(fù)制體位于每個(gè)復(fù)制叉處執(zhí)行著細(xì)菌染色體DNA復(fù)制的聚合反應(yīng)。
單鏈結(jié)合蛋白（SSB，single-strand binding protein):
一種與單鏈DNA結(jié)合緊密的蛋白質(zhì)，它的結(jié)合可以防止復(fù)制叉處的單鏈DNA本身重新折疊回雙鏈區(qū)。
滾環(huán)復(fù)制（rolling-circle replication)：
復(fù)制環(huán)狀DNA的一種模式，在該模式中，DNA聚合酶結(jié)合在一個(gè)缺口鏈的3ˊ端，繞環(huán)合成與模板鏈互補(bǔ)的DNA，每一輪都是新合成的DNA取代前一輪合成的DNA。
逆轉(zhuǎn)錄酶（reverse transcriptase):
一種催化以RNA為模板合成DNA的DNA聚合酶，具有RNA指導(dǎo)的DNA合成、水解RNA和DNA指導(dǎo)的DNA合成的酶活性。
互補(bǔ)DNA (cDNA , complementary DNA)：通過(guò)逆轉(zhuǎn)錄酶由mRNA模板合成的雙鏈DNA。
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)（PCR, polymerase chain reaction):
擴(kuò)增樣品中的DNA量和富集眾多DNA分子中的一個(gè)特定DNA序列的一種技術(shù)。在該反應(yīng)中，使用與目的DNA序列互補(bǔ)的寡核苷酸作為引物，進(jìn)行多輪的DNA合成。其中包括DNA變性、引物退火和在Taq DNA聚合酶催化下的DNA合成。
直接修復(fù)（direct repair):
是通過(guò)一種可連續(xù)掃描DNA，識(shí)別出損傷部位的蛋白質(zhì)將損傷部位直接修復(fù)的方法。該修復(fù)方法不用切斷DNA或切除堿基。
切除修復(fù)（excision repair):
通過(guò)切除-修復(fù)內(nèi)切酶使DNA損傷消除的修復(fù)方法。一般是切去損傷區(qū)，然后在DNA聚合酶的作用下以露出的單鏈為模板合成新的互補(bǔ)鏈，最后用連接酶將缺口連接起來(lái)。
錯(cuò)配修復(fù)（mismatch repair):
在含有錯(cuò)配堿基的DNA分子中使正常核苷酸序列恢復(fù)的修復(fù)方式。這種修復(fù)方式的特點(diǎn)是：識(shí)別出正確的鏈，切除掉不正確鏈的部分，然后通過(guò)DNA聚合酶和DNA連接酶的作用合成正確配對(duì)的雙鏈DNA。
遺傳學(xué)中心法則（genetic central dogma):
描述從一個(gè)基因到相應(yīng)蛋白質(zhì)的信息流的途徑。遺傳信息貯存在DNA中，DNA被復(fù)制傳給子代細(xì)胞，信息被拷貝或由DNA被轉(zhuǎn)錄成RNA，然后RNA被翻譯成多肽鏈。不過(guò)由于逆轉(zhuǎn)錄酶的發(fā)現(xiàn)，也可以以RNA為模板合成DNA。
轉(zhuǎn)錄（transcription):在由RNA聚合酶和輔助因子組成的轉(zhuǎn)錄復(fù)合體的催化下，從雙鏈DNA分子中拷貝生物信息生成單一一條RNA鏈的過(guò)程。
模板鏈(template strand)：
可作為模板轉(zhuǎn)錄為RNA的那條鏈，該鏈與轉(zhuǎn)錄的RNA堿基互補(bǔ)（A-U, G-C)。在轉(zhuǎn)錄過(guò)程中，RNA聚合酶與模板鏈結(jié)合，并沿著模板鏈的3ˊ→5ˊ方向移動(dòng)，按照5ˊ→3ˊ方向催化RNA的合成。
編碼鏈（coding strand)：雙鏈DNA中，不能進(jìn)行轉(zhuǎn)錄的那條DNA鏈,該鏈的核苷酸序列與轉(zhuǎn)錄生成的RNA的序列一致（在RNA中是以U取代了DNA中的T)。
核心酶(core enzyme)：
大腸桿菌的RNA聚合酶全酶由五個(gè)亞基（α2ββ'δ)組成，沒(méi)有δ亞基的酶叫核心酶。核心酶只能使已開(kāi)始合成的RNA鏈延長(zhǎng)，但不具有起始合成RNA的能力，必需加入δ亞基才表現(xiàn)出全部聚合酶的活性。
RNA聚合酶(RNA polymerase)：以一條DNA鏈或RNA為模板催化由核苷-5ˊ-三磷酸合成RNA的酶。
啟動(dòng)子（promoter): NA分子中RNA聚合酶能夠結(jié)合并導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄起始的序列。
內(nèi)含子（introns)：在轉(zhuǎn)錄后的加工中，從最初的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物除去的內(nèi)部的核苷酸序列。術(shù)語(yǔ)內(nèi)含子也指編碼相應(yīng)RNA內(nèi)含子的DNA中的區(qū)域。
外顯子（exons)：既存在于最初的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中，也存在于成熟的RNA分子中的核苷酸序列。術(shù)語(yǔ)外顯子也指編碼相應(yīng)RNA外顯子的DNA中的區(qū)域。
終止因子(termination factors)：協(xié)助RNA 聚合酶識(shí)別終止信號(hào)的輔助因子（蛋白質(zhì))。
核酶（ribozymes)：具有象酶那樣催化功能的RNA分子。
剪接體（spliceosome):大的蛋白質(zhì)-RNA復(fù)合體，它催化內(nèi)含子從mRNA前體中除去的反應(yīng)。
RNA加工過(guò)程（RNA processing)：
將一個(gè)RNA原初轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物轉(zhuǎn)換成成熟RNA分子的反應(yīng)過(guò)程。加工包括從原初轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中刪除一些核苷酸，添加一些基因沒(méi)有編碼的核苷酸，和對(duì)某些堿基進(jìn)行共價(jià)修飾。
RNA剪接（RNA splicing)：從DNA模板鏈轉(zhuǎn)錄出的最初轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中除去內(nèi)含子，并將外顯子連接起來(lái)形成一個(gè)連續(xù)的RNA分子的過(guò)程。
翻譯（translation)：在蛋白質(zhì)合成期間將存在于mRNA上代表一個(gè)多肽鏈的核苷酸殘基序列轉(zhuǎn)換為多肽鏈氨基酸殘基序列的過(guò)程。
遺傳密碼（genetic code):
核酸中的核苷酸殘基序列與蛋白質(zhì)中的氨基酸殘基序列之間的對(duì)應(yīng)關(guān)系。連續(xù)的3個(gè)核苷酸殘基序列為一個(gè)密碼，特指一個(gè)氨基酸。標(biāo)準(zhǔn)的遺傳密碼是由64個(gè)密碼組成的，幾乎為所有生物通用。
起始密碼（iniation codon)：指定蛋白質(zhì)合成起始位點(diǎn)的密碼。最常見(jiàn)的起始密碼是蛋氨酸密碼：AUG。
終止密碼（termination codon)：
任何tRNA分子都不能正常識(shí)別的、但可被特殊蛋白結(jié)合并引起新合成的肽鏈從翻譯機(jī)器上釋放的密碼。存在三個(gè)終止密碼：UAG，UAA和UGA。
密碼子(codon)：
mRNA（或DNA)上的三聯(lián)體核苷酸殘基序列，該序列編碼著一個(gè)指定的氨基酸，tRNA的反密碼子與mRNA的密碼子互補(bǔ)。
反密碼子（anticodon):
tRNA分子的反密碼環(huán)上的三聯(lián)體核苷酸殘基序列。在翻譯期間，反密碼與mRNA中的互補(bǔ)密碼結(jié)合。
簡(jiǎn)并密碼子(degenerate codon)：
也稱之同義密碼子（synonymous codon)。是指編碼相同氨基酸的幾個(gè)不同的密碼子。
氨基酸臂（amino arm):也稱之接納莖（acceptor stem)。tRNA分子中靠近3ˊ端的核苷酸序列和5ˊ端的序列堿基配對(duì)，形成的可接收氨基酸的臂（莖)。
TψC臂（TψC arm)：tRNA中含有胸腺嘧啶核苷酸-假尿嘧啶核苷酸-胞嘧啶核苷酸殘基序列的莖環(huán)結(jié)構(gòu)。
氨酰-tRNA（aminoacyl-tRNA)：在氨基酸臂的3ˊ端的腺苷酸殘基共價(jià)連接了氨基酸的tRNA分子。
同工tRNA（isoacceptor tRNA)：結(jié)合相同氨基酸的不同的tRNA分子。
擺動(dòng)(wobble) ：
處于密碼子3ˊ端的堿基和與之互補(bǔ)的反密碼的5ˊ端的堿基之間的堿基配對(duì)有一定的寬容性，即處于反密碼的5ˊ端的堿基（也稱之?dāng)[動(dòng)位置)，例如I可以與密碼子上3ˊ端的U、C和A配對(duì)。由于存在擺動(dòng)現(xiàn)象所以使得一個(gè)tRNA反密碼子可以和一個(gè)以上的mRNA密碼子結(jié)合。
氨酰-tRNA合成酶（aminoacyl-tRNA synthetase)：
催化特定氨基酸激活并共價(jià)結(jié)合在相應(yīng)的tRNA分子3ˊ端的酶。
翻譯起始復(fù)合體（translation initiation complex)：由核糖體亞基、一個(gè)mRNA模板、一個(gè)起始的tRNA分子和起始因子組成并組裝在蛋白質(zhì)合成起始點(diǎn)的復(fù)合體。
讀碼框( reading frame)：代表一個(gè)氨基酸序列的mRNA分子的非重疊密碼序列。一個(gè)mRNA的讀碼框是由轉(zhuǎn)錄起始位置（通常是AUG密碼)確定的。
SD序列（Shine-Dalgarno sequence)：mRNA中用于結(jié)合原核生物核糖體的序列。
肽酰轉(zhuǎn)移酶（peptidyl transferase)：蛋白質(zhì)合成期間負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)移肽酰基和催化肽鍵形成的酶。
嘌呤霉素（puromycin)：通過(guò)整合到生長(zhǎng)著的肽鏈，引起肽鏈合成提前終止來(lái)抑制多肽鏈合成的一種抗生素。
開(kāi)放讀碼框(open reading frame)：DNA 或RNA序列中一段不含終止密碼的連續(xù)的非重疊核苷酸密碼。
信號(hào)肽（signal peptide):常指新合成多肽鏈中用于指導(dǎo)蛋白質(zhì)跨膜轉(zhuǎn)移（定位)的N-末端的氨基酸序列（有時(shí)不一定在N端)。
轉(zhuǎn)錄因子（transcription factor)：
在轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合體的組裝過(guò)程中，與啟動(dòng)子區(qū)結(jié)合并與RNA聚合酶相互作用的一種蛋白質(zhì)。某些轉(zhuǎn)錄因子在RNA延伸時(shí)一直維持著結(jié)合狀態(tài)。
操縱子（operons):是由一個(gè)或多個(gè)相關(guān)基因以及調(diào)控它們轉(zhuǎn)錄的操縱基因和啟動(dòng)子序列組成的基因表達(dá)單位。
操縱基因（operator)：與特定阻遏蛋白相互作用調(diào)控一個(gè)基因或一組基因表達(dá)的DNA區(qū)。
結(jié)構(gòu)基因（structural gene)：編碼一個(gè)蛋白質(zhì)或一個(gè)RNA的基因。
轉(zhuǎn)錄激活劑（transcriptional activator)：通過(guò)增加RNA聚合酶的活性來(lái)加快轉(zhuǎn)錄速度的一種調(diào)節(jié)DNA結(jié)合蛋白。
阻遏物（repressor)：與一個(gè)基因的調(diào)控序列或操縱基因結(jié)合以阻止該基因轉(zhuǎn)錄的一類蛋白質(zhì)。
衰減作用（attenuation)：一種翻譯調(diào)控機(jī)制。在該機(jī)制中，核糖體沿著mRNA分子的移動(dòng)的速率決定轉(zhuǎn)錄是進(jìn)行還是終止。
亮氨酸拉鏈（leucine zipper):
出現(xiàn)在DNA結(jié)合蛋白質(zhì)和其它蛋白質(zhì)中的一種結(jié)構(gòu)基元（motif)。當(dāng)來(lái)自同一個(gè)或不同多肽鏈的兩個(gè)兩性的α-螺旋的疏水面（常常含有亮氨酸殘基)相互作用形成一個(gè)圈對(duì)圈的二聚體結(jié)構(gòu)時(shí)就形成了亮氨酸拉鏈。
鋅指（zinc finger)：也是一種常出現(xiàn)在DNA結(jié)合蛋白質(zhì)中的一種結(jié)構(gòu)基元。是由一個(gè)含有大約30個(gè)氨基酸殘基的環(huán)和一個(gè)與環(huán)上的4個(gè)Cys或2個(gè)Cys和2個(gè)His配位的Zn2＋構(gòu)成，形成的結(jié)構(gòu)象個(gè)手指狀。
