根據(jù)國家科教領(lǐng)導(dǎo)小組1998年6月9日原則通過的中國科學(xué)院《知識創(chuàng)新工程試點的匯報提綱》，中國科學(xué)院決定組建8個研究基地, 其中之一就是
上海生命科學(xué)研究院。
上海生命科學(xué)研究院是原在上海的中國科學(xué)院8個生命科學(xué)研究所和2個研究中心的基礎(chǔ)上組建而成的。這些研究所和中心是：上海生物化學(xué)研究所、上海細(xì)胞生物學(xué)研究所、上海植物生理研究所、上海藥物研究所、上海生理研究所、神經(jīng)科學(xué)研究所、上海昆蟲研究所和上海生物工程研究中心，上海生命科學(xué)研究中心和國家基因研究中心。這些研究單位共有科學(xué)技術(shù)和管理人員1900人左右，其中有研究員178人，中國科學(xué)院和中國工程院院士26人。
上海生命科學(xué)研究院將圍繞國家戰(zhàn)略目標(biāo)和國際科技前沿，研究當(dāng)代生命科學(xué)重大前沿課題；發(fā)展生物技術(shù)、創(chuàng)新藥物和現(xiàn)代農(nóng)業(yè)技術(shù)研究；培養(yǎng)和造就一批高素質(zhì)、有創(chuàng)新意識的優(yōu)秀年輕學(xué)科帶頭人和科研骨干。
上海生命科學(xué)研究院的目標(biāo)是建設(shè)成為具有國際先進(jìn)水平的生命科學(xué)研究基地，促進(jìn)生物技術(shù)、創(chuàng)新藥物、現(xiàn)代農(nóng)業(yè)技術(shù)等高技術(shù)產(chǎn)業(yè)發(fā)展的基地，以及這些學(xué)科領(lǐng)域的高級人才訓(xùn)練和培養(yǎng)的基地。
上海生命科學(xué)研究院當(dāng)前工作的重點是根據(jù)國家戰(zhàn)略目標(biāo)、國家需要和任務(wù)，組織重大研究項目；深入進(jìn)行基礎(chǔ)研究，把生命科學(xué)一些重要前沿領(lǐng)域的研究推向國際水平；開拓生物技術(shù)、藥物創(chuàng)新和現(xiàn)代農(nóng)業(yè)技術(shù)研究和開發(fā)的新局面; 深化研究所的科研管理體制改革和結(jié)構(gòu)調(diào)整。力爭在近期內(nèi)取得若干具有國際影響的重要成果，為我國的知識創(chuàng)新提供科技儲備。
上海生命科學(xué)研究院將加強(qiáng)上海各生物研究單位的合作、聯(lián)合與整合，突出學(xué)科發(fā)展重點，促進(jìn)各學(xué)科的交叉滲透，發(fā)揮生命科學(xué)與生物技術(shù)基礎(chǔ)研究與應(yīng)用開發(fā)的綜合優(yōu)勢；同時，要深化體制改革和結(jié)構(gòu)調(diào)整，建立與國際接軌的科研管理機(jī)制和科技成果的轉(zhuǎn)化機(jī)制，集中原各單位的行政和后勤管理職能，精干管理隊伍，提高科學(xué)服務(wù)和管理水平，最終形成有利于知識和技術(shù)創(chuàng)新的體系。
根據(jù)生命科學(xué)發(fā)展的趨勢、我國社會經(jīng)濟(jì)發(fā)展的需求以及上海生命科學(xué)研究的現(xiàn)有基礎(chǔ)，上海生命科學(xué)研究院將組織和綜合各研究所的優(yōu)勢力量，作前瞻性布局，在以下重點領(lǐng)域進(jìn)行研究：
基因組、蛋白質(zhì)組與染色體組的研究，包括水稻基因組和人類基因組的研究。要保持水稻基因組研究的良好勢頭，在人類基因組研究上確定有戰(zhàn)略意義的有限目標(biāo)，取得有特色的成果。要努力使基因組和蛋白質(zhì)組的研究的成果促進(jìn)生命科學(xué)的全面發(fā)展和促進(jìn)基因資源的開發(fā)利用，為農(nóng)作物的高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)育種和人類重要疾病的防治作貢獻(xiàn)。
生物大分子結(jié)構(gòu)與功能是各種生命現(xiàn)象和生命科學(xué)各學(xué)科的基礎(chǔ)。蛋白質(zhì)的化學(xué)結(jié)構(gòu)和空間結(jié)構(gòu)的闡明及其與生物功能的相互關(guān)系的研究將為認(rèn)識生命的本質(zhì)、推進(jìn)生物技術(shù)的創(chuàng)新研究與新藥的篩選和創(chuàng)制，以及改善疾病的診斷與防治手段等提供重要信息。
細(xì)胞發(fā)育和凋亡的分子機(jī)制，動植物發(fā)育的遺傳基礎(chǔ)與分子基礎(chǔ)的研究，不僅屬于生命科學(xué)的基本問題，而且和農(nóng)業(yè)、畜牧業(yè)、醫(yī)學(xué)都有極密切的關(guān)系。細(xì)胞凋亡機(jī)理的研究是近年來生命科學(xué)研究的熱點之一，更需要大力發(fā)展。
神經(jīng)生物學(xué)研究，綜合了現(xiàn)代生物學(xué)及物理、數(shù)學(xué)等學(xué)科的發(fā)展成果，正孕育著巨大的革命性進(jìn)展。我們將重點研究對認(rèn)識大腦的奧秘和增進(jìn)人類健康有重要意義的課題，主要是腦發(fā)育和腦功能的分子和細(xì)胞機(jī)制，也將研究重要的腦疾病如老年性
癡呆和巴金森氏癥等的發(fā)病機(jī)制及其防治。
創(chuàng)新藥物的現(xiàn)代理論、應(yīng)用基礎(chǔ)和臨床前研究。以防治我國重要疾病的國家需求為目標(biāo)，以生物活性物質(zhì)的結(jié)構(gòu)、活性和兩者關(guān)系為重點，開展合成和天然產(chǎn)物化學(xué)、分子和細(xì)胞
藥理學(xué)、毒理學(xué)等研究，為實現(xiàn)我國藥物研究和醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)從仿制為主向創(chuàng)新為主的歷史性轉(zhuǎn)變作出貢獻(xiàn)。
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