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根據(jù)教育部部署，山東大學從2008年入學的研究生開始實施研究生培養(yǎng)機制改革。研究生培養(yǎng)機制改革的核心是建立以科學研究為主導的導師負責制和資助制，促進研究生教育與科學研究的緊密結合，實現(xiàn)研究生教育資源的優(yōu)化配置，提高研究生學習、研究和生活條件，構建研究生教育質(zhì)量的長效保障機制。此次改革不涉及增加研究生錄取類別及收費政策的變動，不增加自籌經(jīng)費研究生的比例和收費標準。2007年，山東大學碩士研究生的公費比例超過了87%。預計，2008年碩士研究生的公費比例會更高。
學校將統(tǒng)籌各種資源，構建新的研究生獎助體系。實施研究生培養(yǎng)機制改革后，除單位委托培養(yǎng)的研究生外，研究生助研獎學金的數(shù)額和受益面將得到大幅度提高。增加設立“三種經(jīng)歷”獎學金，鼓勵研究生進行第二校園學習、海外學習和社會實踐；設立優(yōu)秀研究生獎學金，對表現(xiàn)優(yōu)異的研究生給予獎勵。
校設獎學金：最高的是校長獎學金5000元/人，2006年度共有60人受到此獎勵。最低的是校優(yōu)秀研究生干部獎學金，500元/人，2006年度約有250人獲獎。其余還有六項獎學金為1000元/人至2000元/人不等。
社會獎學金：2006年，有2人獲中國科學院獎學金10000元，10位碩士生獲華藏獎學金1000—1200元，有64位碩士生獲光華獎學金1500—2000元，10位碩士生獲浦東發(fā)展銀行獎學金5000元，55位碩士生獲將軍集團獎學金3000元，15位碩士生獲小松中日獎學金2000元。此外還有部分學生獲得4000——10000元的IBM中國優(yōu)秀學生獎學金以及中國惠普優(yōu)秀學生獎學金。醫(yī).學.全.在.線m.gydjdsj.org.cn
此外，山東大學作為國家留學基金委“國家建設高水平大學公派研究生項目”的實施院校之一，從2007年到2011年，山東大學每年將派出至少100名研究生赴國外高水平大學攻讀博士學位或進行博士生聯(lián)合培養(yǎng)。山東大學還設立了“研究生海外留學基金”，資助研究生到國外著名高校進行聯(lián)合培養(yǎng)，2006年資助66人。
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