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（1)MeSH轉(zhuǎn)換表（MeSH Translation Table)，包括MeSH詞、參見詞、副主題詞等。如果系統(tǒng)在該表中發(fā)現(xiàn)了與檢索詞相匹配的詞，就會自動將其轉(zhuǎn)換為相應(yīng)的MeSH詞和TextWord詞（題名詞和文摘詞)進行檢索。例如：鍵入“Vitamin h"，系統(tǒng)將其轉(zhuǎn)換成"Biotin [MeSH Tems] OR Vitamin h [Textword]"后進行檢索。
（2)刊名轉(zhuǎn)換表（Journal Tanslation Table)，包括刊名全稱、MEDLINE形式的縮寫和ISSN號。該轉(zhuǎn)換表能把鍵入的刊名全稱轉(zhuǎn)換為“MEDLINE縮寫[Journal Name]"后進行檢索。如：在檢索提問框中鍵入：“new england journal of medicine", PubMed將其轉(zhuǎn)換為"N Engl J Med [Journal Name]"后進行檢索。
（3)短語表（Phrase list)。該表中的短語來自MeSH、含有同義詞或不同英文詞匯書寫形式的統(tǒng)一醫(yī)學(xué)語言系統(tǒng)（UMLS: Unified Medical Language System)論.文.客.服.QQ，81995535和補充概念（物質(zhì))名稱表[Supplementary Concept (Substance) Name]。如果PubMed 系統(tǒng)在MeSH和刊名轉(zhuǎn)換表中未發(fā)現(xiàn)與檢索詞相匹配的詞，就會查找短詞表。
（4)著者索引（Author Index)。如果鍵入的詞語未在上述各表中找到相匹配的詞，或者鍵入的詞是一個后面跟有1~2個字母的短語，PubMed即查著者索引。如果仍然找不到匹配詞，PubMed就會把該詞斷開后再重復(fù)上述自動詞匯轉(zhuǎn)換過程，直到找到與鍵入的詞語相匹配詞語為止。若仍然沒有匹配詞，單個詞會被聯(lián)一起（用AND)在全部字段中檢索。如："single cell"，系統(tǒng)就會自動將其分成兩個詞：“single“和“cell”檢索，其檢索表達式為：“single AND cell”。
要查驗檢索詞的轉(zhuǎn)換情況，可點擊“Details”鍵。
2.截詞檢索功能 PubMed 允許使用“*”號作為通配符進行截詞檢索。如：鍵入“bacter *”，系統(tǒng)會找到那些前一部分是bacter的單詞（如bacteria, bacterium, bacteriophage等)，并對其分別進行檢索。如果這咱詞少于150個，PubMed會逐個詞檢索，若超過150個（如：Staph*),PubMed將顯示如下警告信息：“Wildcard search for 'term*' used only the first 150 variations. Lengthen the root word to search for all endings"。截詞功能只限于單詞，對詞組無效。如：“infection*”包括“infections”，但不包括“infection control”等。
使用截詞功能時，PubMed系統(tǒng)會自動關(guān)閉詞匯轉(zhuǎn)換功能。
3.強制檢索功能 如上所述，在PubMed主頁的檢索提問框中鍵入一個短語后點擊“Go”，系統(tǒng)會高速用自動轉(zhuǎn)換功能查找到相應(yīng)的匹配詞后再進行檢索論.文.客.服.QQ，81995535；但是，當(dāng)鍵入的詞語無匹配詞時，PubMed就會將鍵入的詞語斷開后再重復(fù)上述自動詞匯轉(zhuǎn)換過程，若仍然沒有匹配詞，系統(tǒng)就將短語分解成單詞，再用AND聯(lián)在一起在全部字段中檢索。很明顯，這樣檢索的結(jié)果是不符合用戶要求的。因此，PubMed允許使用雙引號（“”)來強制系統(tǒng)進行短語檢索。例如，在PubMed主頁的檢索提問框中鍵入“Single cell”，并用雙引號引起來，然后點擊“Go”，系統(tǒng)會將其作為一個不可分割的詞組在數(shù)據(jù)庫的全部字段中進行檢索。 使用雙引號檢索，會自動關(guān)閉詞匯轉(zhuǎn)換功能。
4.鏈接功能
（1)鏈接相關(guān)文獻。PubMed系統(tǒng)中的每條文獻記錄均有一個相關(guān)文獻鏈接，在檢索結(jié)果的顯示狀態(tài)下，每條記錄的右邊均有“Related Articles”超鏈。點擊該鏈，系統(tǒng)按文獻的相關(guān)度從高到低顯示相關(guān)文獻。 利用檢索史（History)按鈕能進一步限制相關(guān)文獻。點擊“History”，把相關(guān)檢索式的編號錄入檢索提問框，然后再鍵入附加條件詞，最后點“Go”。如在檢索提問框中鍵入“#7 AND english[la]”，可將檢索進一步限定在英文文獻范圍內(nèi)。
（2)鏈接NCBI（National Center for Biotechnology Information)數(shù)據(jù)庫。PubMed在其主頁上與NCBI的5個數(shù)據(jù)庫建立了超鏈接。這些數(shù)據(jù)庫包括：Protein[氨基酸（蛋白質(zhì))序列]數(shù)據(jù)庫，Nucleotide(DNA序列)數(shù)據(jù)庫，Popset(種群、種系發(fā)生或突變序列)數(shù)據(jù)庫醫(yī)學(xué)全在,線m.gydjdsj.org.cn，Structure（分子結(jié)構(gòu)模型)數(shù)據(jù)庫和Genome(基因組序列)數(shù)據(jù)庫。
（3)鏈接外部資源。PubMed提供從檢索結(jié)果到期刊全文、生物學(xué)數(shù)據(jù)、序列中心等的鏈接。該功能通過鏈接上述資源站點的方式來實現(xiàn)。在檢索結(jié)果顯示狀態(tài)下，點擊“LinkOut”進入相關(guān)網(wǎng)站。
（4)鏈接相關(guān)圖書。點擊“Books”，可參考相關(guān)書籍的文摘頁。書籍文摘頁上的某些短語是超鏈接，點擊短語超鏈，可連到相關(guān)圖書的頁碼表，可在表上找到有關(guān)短語。
此外，PubMed系統(tǒng)允許用戶查看被引期刊名稱表，點擊主頁上的PubMed Journal power即可，PubMed向用戶提供期刊的縮寫名稱和ISSN號。
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